Sarcospan (SSPN) - upstream reference sequence

Contains alternative promoter/exon 01b  


          .         .         .         .         .             g.57
   gtgaggatactcaagcagccctgtggataggccatctggaaaggaaacaacacgctt    c.-5281

.         .         .         .         .         .             g.117
tcaagatgcattagccgcctgggaagcagatcttcctgcttcagctaagactggaacctc    c.-5221

.         .         .         .         .         .             g.177
ctgatcccaggcctccagtctttaagtctttcagctgagagtcgagagataacaggaaga    c.-5161

.         .         .         .         .         .             g.237
aacaaaccatccctgctgtgtgctgtttgaatatttgacccacagaaaccatgaaataat    c.-5101

.         .         .         .         .         .             g.297
aattactgtttcaaatcactgaatgttggggtgatttgttattgtagcaatagataatta    c.-5041

.         .         .         .         .         .             g.357
aaacagaggatctagaatggcagtagaggcattaggagagtttggtgagatgaatttata    c.-4981

.         .         .         .         .         .             g.417
aaaaacctacttgttctattattaattactgagggacatccagtgactccctgtatttct    c.-4921

.         .         .         .         .         .             g.477
ctttttattacacttttaaaaattgagatgtcattgtatacaataacatgcacagatcat    c.-4861

.         .         .         .         .         .             g.537
aagtgttgttcaatgacttttgacaactaagacccatatgatcaccaaagatacagaaga    c.-4801

.         .         .         .         .         .             g.597
cttacttccatcacccagaaagtcacctcttactcctttcgagacaattctctcatccca    c.-4741

.         .         .         .         .         .             g.657
actcctcaatcactttttaaattaccatagattcattttgccttctaaaacttttataca    c.-4681

.         .         .         .         .         .             g.717
aatggaattatgcagtatgtattattttgtgtctggtttctttcactcagcacactgtta    c.-4621

.         .         .         .         .         .             g.777
atgagatttatccaagtcattgcctgcatcaatagttcaccccttttcttattagcaagt    c.-4561

.         .         .         .         .         .             g.837
ggtattccactgtatggatatgccacaatttgtttatccattcttctcctgtatttctca    c.-4501

.         .         .         .         .         .             g.897
attaaaataaatttagttatttctacagtatcatatgcagtggaaaaatcaaaattacat    c.-4441

.         .         .         .         .         .             g.957
gtagaaaaatttggtattataaaaagcaccttaaaaataggtgaaatgcatgattaaatg    c.-4381

.         .         .         .         .         .             g.1017
attgaaatttatcacctctatagccctccagagaatgaaaaagttaagccaggtatggtg    c.-4321

.         .         .         .         .         .             g.1077
gcatgtgcctatagtcctagctgctcaggaagctgagctgggaggtttgtttgagcacag    c.-4261

.         .         .         .         .         .             g.1137
gtttgagtccagcctgtgcaacatagtgagaccccatctccagggaagaaagagagagag    c.-4201

.         .         .         .         .         .             g.1197
agagaatgagaaagtcataagccctttgttgaccataaagattgcattgtccatatgata    c.-4141

.         .         .         .         .         .             g.1257
tttaacttgaaaatacaaacttgcaagcaaaaattataaatgggtcaattctgctgagaa    c.-4081

.         .         .         .         .         .             g.1317
aaaaattaagcccaaaggcacatttagaattaatgacataggaataaagaaaataaaaaa    c.-4021

.         .         .         .         .         .             g.1377
aataggagttgctttaatttgttctacacacacacacacacacacacacacacacacaca    c.-3961

.         .         .         .         .         .             g.1437
cacacaaatacacacacagaggtcagcaatatccctagagtcattttaggtatggcggcc    c.-3901

.         .         .         .         .         .             g.1497
agcaaggcatatgggggcagtggtcctgcatatcacaaatgaattcccaattgttttctg    c.-3841

.         .         .         .         .         .             g.1557
cagagtatttgatacttctttaaatcaaatctaattgaacatttcagatagatttagtta    c.-3781

.         .         .         .         .         .             g.1617
catatgaaaaagacttgatatagaccttggaaatgtaataatttttttctgaaatccttt    c.-3721

.         .         .         .         .         .             g.1677
tttgttcttggggaatgtaagatcatgtgtttgagaatatgttggtttaaagattatttc    c.-3661

.         .         .         .         .         .             g.1737
tagttgggtttcctaagacattttgttaatcacactagttttaaagagttatcatcttcc    c.-3601

.         .         .         .         .         .             g.1797
ccgttctgaacttctgatgcataaatacttcaaaataatgttaagtttgagatagtctgc    c.-3541

.         .         .         .         .         .             g.1857
aaagatagagatactggcttgattttgttttctcccccaagaggatcaaaataatctaaa    c.-3481

.         .         .         .         .         .             g.1917
ccatatattaactactgtcctgcaatttctaatttacaatctttgtcagttttgaattat    c.-3421

.         .         .         .         .         .             g.1977
ggaagcagccaagagtatccaaaaacattttgtttctactgcgccttttttcccggtaat    c.-3361

.         .         .         .         .         .             g.2037
ataaatatctgaagaggttattgcttaacctataaaatagtgacatcataatttatgaat    c.-3301

.         .         .         .         .         .             g.2097
actgaaaaacccagttcatttctgttaaactctatgatgagctagacgtgatgatttttt    c.-3241

.         .         .         .         .         .             g.2157
ctcagtggaaaggacatgtaaaaggaagagttttctttgttgtatccttaatgacagtct    c.-3181

.         .         .         .         .         .             g.2217
tatctattttagccttgattactctctatcactatttgacagtaacttttctttgtttct    c.-3121

.         .         .         .         .         .             g.2277
actttcaaatatcaattaagtgaaaatgacatcctcgtcactatcatcttatgttattac    c.-3061

.         .         .         .         .         .             g.2337
caaagaccaggcctcctcaaacacagattcaaccatgctgttgggaagctgagcaggtgt    c.-3001

.         .         .         .         .         .             g.2397
gagtttccctagaccaccaaaggctgaaaattgtagtctgcagttgtaatcagactagaa    c.-2941

.         .         .         .         .         .             g.2457
gaatttcagtgcgtctgggatgttgttcatttacattgctttcatttgtaatgtgtctca    c.-2881

.         .         .         .         .         .             g.2517
gtgaggcaatcaaaagtaagcttttttaaaaagtatatatgtacaactgttttacaactg    c.-2821

.         .         .         .         .         .             g.2577
taagccactagtctgaaactcagaagacaaatgtatagcaatatcctactatcttgtttg    c.-2761

.         .         .         .         .         .             g.2637
actatttaaacttacatataatttaaggttttgaggaaaaggctaaaaatgtttcacttt    c.-2701

.         .         .         .         .         .             g.2697
taattgcatgacaatttggcagtatggtcagcaaatagaacttgtatctagttataaact    c.-2641

.         .         .         .         .         .             g.2757
agtactaataggaataatggtctccactgactattaaatatatactatggtgatgaatca    c.-2581

.         .         .         .         .         .             g.2817
agatatttttgtaaagtactcatctctaggtctaagtttgtaattcactgtattatagat    c.-2521

.         .         .         .         .         .             g.2877
actatgctacccatgataattaaattgtttaaaatcacaatttaaacagtctagccactt    c.-2461

.         .         .         .         .         .             g.2937
gtttgcctataggcaatatacatacaggaagtaattaataaagcagttaatcctttagac    c.-2401

.         .         .         .         .         .             g.2997
cattggctttggagttcacatctggttccacttacccccattcataagtaggctagtgac    c.-2341

.         .         .         .         .         .             g.3057
tttaatccaattacttaataattctgatactcaaattttttcatctttaaaagtggaaac    c.-2281

.         .         .         .         .         .             g.3117
tataattataaggtggttataaggggtgacaataaaatatgtaaagcacctgtcatgtgt    c.-2221

.         .         .         .         .         .             g.3177
ttgttacagaatactcagtaataggtagctatattgttaataacaatacatacttgattc    c.-2161

.         .         .         .         .         .             g.3237
caggtagtcaattgactttctataaatatttaccatatttccataggaaaaccaagcatt    c.-2101

.         .         .         .         .         .             g.3297
ttgttgttttgtcatttgggttcttctcagtcaggcccaagtcaggtgggtgtcctggta    c.-2041

.         .         .         .         .         .             g.3357
taacgccagtttttatttgtctgttcacaatagaaagcccttgtggtgtgatggccccaa    c.-1981

.         .         .         .         .         .             g.3417
agctgaccataaacttgcctcagccactctgtttttctggtaagagtgagtgctatttct    c.-1921

.         .         .         .         .         .             g.3477
actgcctctgcatggaactgggatgtgtggtttagattctgttttctaagcaaatgtatt    c.-1861

.         .         .         .         .         .             g.3537
tgttccctgaaccattatttttctcactggtccagatggaaggcataaggagaacaccta    c.-1801

.         .         .         .         .         .             g.3597
agttcataaaataagtaagggtgaagtacatactttttgtcttcaaagttacttttgtgg    c.-1741

.         .         .         .         .         .             g.3657
ggacttggcagtttacaaaaagagctgatgatgattagtttctaattctaaagcaaacag    c.-1681

.         .         .         .         .         .             g.3717
cagggaattggattttctttaaattttccaatagcaaacaagctaggagtagcctttatc    c.-1621

.         .         .         .         .         .             g.3777
ctaacatcttggcaacatcacttatttttgaatatagctttctgaatgttacaatgacca    c.-1561

.         .         .         .         .         .             g.3837
taccaaaggagatataaatacccccaaagtgatgggatcattttttagtggtttcgctga    c.-1501

.         .         .         .         .         .             g.3897
aatttgctctaagtgctactgagtagaggtatgcgggaataagaataatcagttttattg    c.-1441

.         .         .         .         .         .             g.3957
atttcttctgtgactctgggccaggaccaagtctattttgaacatctttatatcctagca    c.-1381

.         .         .         .         .         .             g.4017
cattgtaggtgctttaaaaataactcttaaatattgactgagtaaaagcgtctatctcta    c.-1321

.         .         .         .         .         .             g.4077
agatggtcaatccaatccccctaagcactgttgtggagatgagtgaagactaactaggag    c.-1261

.         .         .         .         .         .             g.4137
tcttgctctgtcgcccaggctggagtgcagtgccatgatcacggctcactacaacctctg    c.-1201

.         .         .         .         .         .             g.4197
cctcccaggttcaagcgattctcctgcctcagcctcccgagtagctgagactacaggtgc    c.-1141

.         .         .         .         .         .             g.4257
gtgccaccacgcctgtctaatttttgtagttttagtggagacggggtttcaccatgttgg    c.-1081

.         .         .         .         .         .             g.4317
ccaggctagtcttgaactcctgaccttgtgatccgcccacctcggcctcccaaagtgttg    c.-1021

.         .         .         .         .         .             g.4377
ggattacaggcgtgagccaacagagcttttaaaaacaaatacacgtgagaggccgggtgc    c.-961

.         .         .         .         .         .             g.4437
atggtggctcacgcctgtaattccagcactttgggaagctgaagcagcaggatcccttga    c.-901

.         .         .         .         .         .             g.4497
agccaggagttcaagaccagtttggacaacataatgagatcccatctctatgaaaaaaat    c.-841

.         .         .         .         .         .             g.4557
tttaaaaaattagccagatgtggtggtgattgcctgtagtcccagccacttggagactga    c.-781

.         .         .         .         .         .             g.4617
ggagagagaagctgttgagtccaggagtctgaggctgcagtgagctaggatggtgacaat    c.-721

.         .         .         .         .         .             g.4677
gcactccagcctgggcaacacagtgagcccctgtttggaaaataataataataattaata    c.-661

.         .         .         .         .         .             g.4737
acatatgtgaaagagagttcacaattagtccaatatctttagaaagattcaaaaacacct    c.-601

.         .         .         .         .         .             g.4797
aaatgcgaaaaatgcctttattcatttgtcagctggattacagaaagtaggaagaaaaga    c.-541

.         .         .         .         .         .             g.4857
gcctgtgcctctgtaggaaagtaacaacgacttaacttctggaaatgacttcgcagctta    c.-481

.         .         .         .         .         .             g.4917
gagcccagcagtgcctattttggattaaactgtgtattaattaagctcaaacgatttcaa    c.-421

.         .         .         .         .         .             g.4977
cattcatcaccttgcattgcacttcacagaaagcaaaaccaaaacaatcctggagttttg    c.-361

.         .         .   |        .         .         .             g.5037
agtgaggaaaacagacgccccgc | actcgcacacgcgcgcactcgcagcctgtctgaagtg    c.-301
                        ^  alternative exon01b

.         .         .         .         .         .             g.5097
cagaggttcaggcggccaagggacccgcgccggtttccgcgggcgacctgcaaatcctgc    c.-241

.         .         .         .         .         .             g.5157
ccggggcccggcaggcgctgcgtcccggcgcgttggcagttggcgacccccctcgaatcc    c.-181

.         .         .         .         |  .         .             g.5217
cccctctgctgcgggctccccgtggcctttggaggctcg | gtgagtcggctccaaatgttt    c.-121
                                        |

.         .            .         .         .         .          g.5277
tccatatttgttcagcctcc \ ataattcgaataccagggcaggccgagccagccgtgcgcc c.-61

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