serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 1 (SPTLC1) - 8657 nt intron 06 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.52503
gtaagtaaactttacgtagttttctaatagcagttcctttgaaataatactgactgtctt  c.560+60

         .         .         .         .         .         .  g.52563
agagaaatacttcattagaagttatctgcataaaataatgctgctttttgtttttcaaga  c.560+120

         .         .         .         .         .         .  g.52623
aatagtcacctcaccaaaggtttcaaaatttgtgaaaccttcacttaaaagatgcttaac  c.560+180

         .         .         .         .         .         .  g.52683
ggtgtctatagtcatttatctgccatggtaattatttattgatgtccagatgaggacagc  c.560+240

         .         .         .         .         .         .  g.52743
tatctgccttctttgtgcagctctgtggctgtgtggtatcctagtctgtggtcaccacct  c.560+300

         .         .         .         .         .         .  g.52803
cacgttgtcagtcagactgcccggcaaagtctctccatgtctcatcacccattcaccccg  c.560+360

         .         .         .         .         .         .  g.52863
tcacctggtctcagctgatcttgcttcctaccttattaaggatagaggagccgtgacttg  c.560+420

         .         .         .         .         .         .  g.52923
gacacttctttgactacccacaagtggatcttcacactcgcgtgcctgtgctgaatgcat  c.560+480

         .         .         .         .         .         .  g.52983
gctaccgaggtttactgtgaagggcagggtacagccaagcaagggctggcaggccccagg  c.560+540

         .         .         .         .         .         .  g.53043
cagctggttaaaccagtcagaagcatctgctgccccaagccaagccctgtcgtcctatga  c.560+600

         .         .         .         .         .         .  g.53103
gtggactaaaatttggtctcaaattgactttaatttcctcttctctgttttttttttttt  c.560+660

         .         .         .         .         .         .  g.53163
tgtgtgtgagatggagtctcactttgtcaccacggctggagtgcaatggcgcaatcttgg  c.560+720

         .         .         .         .         .         .  g.53223
ctcactgcaacctccgcctcccaagttcaagcaattctcctgcctcagtctcctgagtag  c.560+780

         .         .         .         .         .         .  g.53283
ctgggattacaggcatgcgccaccatgcctggctaattttttgtattttcagtagagaca  c.560+840

         .         .         .         .         .         .  g.53343
gggttttaccgtgttggccaggctggtctcaaactcctgacctcaggtgatccacctgcc  c.560+900

         .         .         .         .         .         .  g.53403
tcggcctcccaaagtgctaggattacaggcgtgagccaccgcacctggcctttttttatt  c.560+960

         .         .         .         .         .         .  g.53463
tttattttttaattttttttattttgagatggagtttcactcttgtcgcccaggctgaag  c.560+1020

         .         .         .         .         .         .  g.53523
tgcagtggagtgatcttggctcacagcaagctccgcctcccgggttcaagcaattctctt  c.560+1080

         .         .         .         .         .         .  g.53583
acctcagcctctcaagtagctaggaccacaggcacccaccaccaaacctagctaattttt  c.560+1140

         .         .         .         .         .         .  g.53643
tgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttggccaggctggtcttgaactcctggg  c.560+1200

         .         .         .         .         .         .  g.53703
attacaggcgtgagccactgtgcctggcctcctcttttcctttttaacatcacagccaga  c.560+1260

         .         .         .         .         .         .  g.53763
gtaatctttttaaaatgtaaatcctattttgtcacattttatttaatacaatttagagct  c.560+1320

         .         .         .         .         .         .  g.53823
tctattgttcctaaaataaagacccaagtcctttgtatgatcttgtgagctctgcatcac  c.560+1380

         .         .         .         .         .         .  g.53883
tttttcaggctgattttgtaccattttccctgaggtgtttaagctgtagccttgccagcc  c.560+1440

         .         .         .         .         .         .  g.53943
ctgtatgctagtgtcctctcaccttggggcccacgcacatgctctttctgactagaacac  c.560+1500

         .         .         .         .         .         .  g.54003
tgttcctcctcccttctcctacttaaccttctcatccttcacatacgtcacctctgcagg  c.560+1560

         .         .         .         .         .         .  g.54063
gaggccgtcccacacctcagagcaggtcaagacccctgctgcatgtggacaaaatcttac  c.560+1620

         .         .         .         .         .         .  g.54123
agccagagagaatttattgttcttgtttatccatgctcacacgagcactcaaactgcctg  c.560+1680

         .         .         .         .         .         .  g.54183
tcaaggtcaccctgcttctcaagcctccctcccacacacagacacacacactctctcaca  c.560+1740

         .         .         .         .         .         .  g.54243
cgcaccctgctctgctcatttgcttcatacttactgtacttttcttttgtagagcttgta  c.560+1800

         .         .         .         .         .         .  g.54303
acagtttataattttatatctgtgtggttatttgcttctgtttcttgctgggagcccatt  c.560+1860

         .         .         .         .         .         .  g.54363
acttagaatagtatttatcatttagtaatggtcaataaacagtagttcagtaaatgaatg  c.560+1920

         .         .         .         .         .         .  g.54423
aaaggaagctggagctcagaataggggccagataactgtgttgcagagcctggcatccct  c.560+1980

         .         .         .         .         .         .  g.54483
caagccctgcactggcctcttgcttaccactcaccgttggaacgcttgtgcagcgacaga  c.560+2040

         .         .         .         .         .         .  g.54543
accttctatcataattactacagagctgactctacctggggcttctgcagtacatgtgac  c.560+2100

         .         .         .         .         .         .  g.54603
ccattcctcactatagccctacagcagtctaggagcactacagcaaatgtcctgggtcta  c.560+2160

         .         .         .         .         .         .  g.54663
agtagtatactaatgtgaccataaaaatgaatatttttattaatttttggcaaatagttt  c.560+2220

         .         .         .         .         .         .  g.54723
aaaaaataatgtgaaagactcatcactaactgaagcgccattgacttaaacagtgtttct  c.560+2280

         .         .         .         .         .         .  g.54783
aggtttttagtaaaagcagagttacagacagctgcagtgtcattcagtgtcactttatac  c.560+2340

         .         .         .         .         .         .  g.54843
acaagcaccccactataaattcttttaaagtccagaaaaagttgatggttactggtgaac  c.560+2400

         .         .         .         .         .         .  g.54903
tcctatgcttcctttgataaatactacattgtgtttttttttttaactgctaggaaacat  c.560+2460

         .         .         .         .         .         .  g.54963
aggctaaattcacttccatgtgttatgcccagtgtcttaaaatttccatttccagtgagt  c.560+2520

         .         .         .         .         .         .  g.55023
tgctaacctgtttattctgctacgtaattttaaatactctacctgaaatgtgtttgaatg  c.560+2580

         .         .         .         .         .         .  g.55083
taggagtgctagaggtaaacatggtgtttggtaaattggttttgataaatttgtcaggca  c.560+2640

         .         .         .         .         .         .  g.55143
tagacactgtgtgatgcttcatttccttcctttcagtaaacagtgttaatgctttgccaa  c.560+2700

         .         .         .         .         .         .  g.55203
tagtggggctcagcacagtggtcattcatggacttaagtctgtcctatcactccactaag  c.560+2760

         .         .         .         .         .         .  g.55263
tatgtgttcatgctgcttcacagatctttttaaaattaaactttttacattcagataatt  c.560+2820

         .         .         .         .         .         .  g.55323
gtagattcaaaagcacttgtaagaaataatatagaaatcctttgtactttttactaagtc  c.560+2880

         .         .         .         .         .         .  g.55383
tcttccagtgaggacctcttgcaaaacgaacagtttcacagccaggatattgactttgtc  c.560+2940

         .         .         .         .         .         .  g.55443
attgtcaagatgcagaacatttctgtcgccacagggatccttcatgttgccacatccaca  c.560+3000

         .         .         .         .         .         .  g.55503
ttcctcccatctgcccactccttaactcctggcaaccactaatctgttctgtttgttaat  c.560+3060

         .         .         .         .         .         .  g.55563
tttgttattttaagaattttatacaaatggaatcatccagtaggcaacactttggggttg  c.560+3120

         .         .         .         .         .         .  g.55623
gcttttttcatttagcgtaattctctgatggttcatccaagttgttgcttgtatccagag  c.560+3180

         .         .         .         .         .         .  g.55683
ttggttccttttgattgatgagtattactccatggcatgaaggtaccactgttattgaag  c.560+3240

         .         .         .         .         .         .  g.55743
ttaccttttaaagacatctgagttgttgccagctttgtgctgttataaaaaaaaagctgc  c.560+3300

         .         .         .         .         .         .  g.55803
tctaaacattcatgtacattcatgctatgtgagcataagtttttatttctgtggaataca  c.560+3360

         .         .         .         .         .         .  g.55863
tgccaaggaatgcagttgctatgtttatagtattgcatagtttttaaaggaactcctaaa  c.560+3420

         .         .         .         .         .         .  g.55923
ctattttccaaagtgtctataccattttatgttcccatcagcaagatatgaatgatcaag  c.560+3480

         .         .         .         .         .         .  g.55983
gttctccacatcttcagaagcatttggtgttatcactacttttttagccagtctgatagg  c.560+3540

         .         .         .         .         .         .  g.56043
tgtatagaaaaatttatatttttctgatggctaatgatgttgaacatccattcatgtgca  c.560+3600

         .         .         .         .         .         .  g.56103
tatttgccatctcttcagtgaaatgtcttttcatgtccattttctagttgtatgatttgt  c.560+3660

         .         .         .         .         .         .  g.56163
ttttatactaatgagttttgagagttctttatacattctagatcatagttctttatcaga  c.560+3720

         .         .         .         .         .         .  g.56223
tatgtggtttgcaaatacaaattttgatgtccacgtattcattgctaaaatatagaaatg  c.560+3780

         .         .         .         .         .         .  g.56283
aagtggattttttgtgtgctgagcttgtatcctgcaaccttgccaaactcacttaattag  c.560+3840

         .         .         .         .         .         .  g.56343
ctctaggaactgtttttctagattgcttaggattttccatgtagacagtcgtcatgtcat  c.560+3900

         .         .         .         .         .         .  g.56403
ctgtaaatagttttatttattttctaatctacttactttttattcccttttattgcctta  c.560+3960

         .         .         .         .         .         .  g.56463
ttgcactggcaagaacttccaggactgtgttaaaagtagtaagagaagacattcttgccc  c.560+4020

         .         .         .         .         .         .  g.56523
tattcctgatattagaaagcgtttactctttcaccaataagtataatgttacgtgcagat  c.560+4080

         .         .         .         .         .         .  g.56583
ttcttacagatgctctttattacattcactttcctgcacctcatcttttttttctgagca  c.560+4140

         .         .         .         .         .         .  g.56643
ttttcattgcaaatcaatgtgaatttggttggtcaactactttttctgtattggttgata  c.560+4200

         .         .         .         .         .         .  g.56703
tgatcatgtgatttttcttttttagtctcttaatgtggtggataacattgatttattttc  c.560+4260

         .         .         .         .         .         .  g.56763
aaatattgaaccagccttgcatacctgaaataaataccacttggttatggggtataattt  c.560+4320

           g.56772
tttttttat  c.560+4329

--------------------- middle of intron ---------------------
                                        g.56773               g.56780
                                        c.561-4328  aaaaagct  c.561-4321

.         .         .         .         .         .           g.56840
aaattcgatttgccagtcttttgttaaggattttgaatctgtgttcatgagggagattgt  c.561-4261

.         .         .         .         .         .           g.56900
cctataatacactttttttgatacttactttggttttggtagcagaataacacttcacag  c.561-4201

.         .         .         .         .         .           g.56960
aatcaattgggaagcgttctatcttctattttgtggagctatttgtatagaattactttt  c.561-4141

.         .         .         .         .         .           g.57020
aattatttaattgtttggtagaattctcccatgaaaccatctgggcctggagagatttct  c.561-4081

.         .         .         .         .         .           g.57080
tttttgcaagtatcttaattctgaattcagtttccttagtagttatcaggctattcaaat  c.561-4021

.         .         .         .         .         .           g.57140
tatctgtcatattgagtgaattgaggtagtttgtgtttttcaaggaattggtccatttct  c.561-3961

.         .         .         .         .         .           g.57200
taaaagttgtcagatgtacatgtgtggtgctgttcatggtattcccgtattattctgatg  c.561-3901

.         .         .         .         .         .           g.57260
tctgcagagtccacagttatataccttgtttcactcctggtattggtaatttgtgccttt  c.561-3841

.         .         .         .         .         .           g.57320
tctcctgttttctttgtcagtcttgttagaggtctgtcaattttattgatcttttgaaag  c.561-3781

.         .         .         .         .         .           g.57380
aatcagctctttgtttcattgtttttctctattgtatttttattgtcagttccattgatt  c.561-3721

.         .         .         .         .         .           g.57440
gatttctcctattatttcctgccttctgctgacgtttggtttattttgttctttttcttg  c.561-3661

.         .         .         .         .         .           g.57500
atttggaggtaagagcttaaattattaatttgaaactttttctcttttcttgaatgttca  c.561-3601

.         .         .         .         .         .           g.57560
tttagtgcaatgaattgccctctcaacactactttagttgtgtctcacaaattttgatgt  c.561-3541

.         .         .         .         .         .           g.57620
gttgtgttttcatttgtatttagttcatttttgttttgttttaagaaatagggtgtcatt  c.561-3481

.         .         .         .         .         .           g.57680
attttgctctggttggccttgaactcctgggctcaatggattcttttgcttcagcctcct  c.561-3421

.         .         .         .         .         .           g.57740
gggtagttgggactacaaaaacacaccactatgcccagcttacactttccctttgaccta  c.561-3361

.         .         .         .         .         .           g.57800
tggattatttagaagtgtattgtttacttttcaggtgtttggggactttaaatttgttgt  c.561-3301

.         .         .         .         .         .           g.57860
agtttggtttatggctaatacggtagtctattttggaatatcttatatgggcacttaaaa  c.561-3241

.         .         .         .         .         .           g.57920
aatgtgtattctgctgctgtttggtggagtgttctataaatgtcaagtctttttggttga  c.561-3181

.         .         .         .         .         .           g.57980
tggtgtttttgggttcttctgtcttggtgattttctgtctagttcttctatcagttgttg  c.561-3121

.         .         .         .         .         .           g.58040
aaggataatgaagtttccaactgtaattgtgggtttgtctatttctttcagttttatcag  c.561-3061

.         .         .         .         .         .           g.58100
tggttgcatctcaaatttagcttttttgtttagttcatatttaggattactaagttttct  c.561-3001

.         .         .         .         .         .           g.58160
tgatgaattgacccttttagcgtttcataatgttcttctctgtctctgataattttccac  c.561-2941

.         .         .         .         .         .           g.58220
tttttgtgtatgtgctgccaaagcaaacactctgataattttctttcttccaaagtttac  c.561-2881

.         .         .         .         .         .           g.58280
tttgtcagataccctttttattattttttatattacatagttgtgtgtataaatctgtat  c.561-2821

.         .         .         .         .         .           g.58340
tttttactacctatattattatatttgtagtgagtttcttacagacagcatatagttggg  c.561-2761

.         .         .         .         .         .           g.58400
tcatgttatttaatttattctacctgcctgtctttaaatcatgtatttgtacatttacat  c.561-2701

.         .         .         .         .         .           g.58460
ttaatgtaattattgacatagtagagtttaagtctgttaaaacaaagtctgccattttgc  c.561-2641

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tttttgtttcttgtttgttcactctactttgtgtttctctattttctcttttctgccttt  c.561-2581

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ctgtgggctaattgaacatgtttttagaatttactttttctttgtatagctttttttagt  c.561-2521

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cattactctgagtgttacattacacatatattataatagactactggtgtcattgtacca  c.561-2461

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attcaagtgtagaaacttttaccttcctttacattcctttatttgcctcatttacattat  c.561-2401

.         .         .         .         .         .           g.58760
aattgttttaaatatttcctgtacatacagtgagaaccacatcagtgttttaatttttgc  c.561-2341

.         .         .         .         .         .           g.58820
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ccatattttttacttactgtgctccttcctccttcctgataatctaacagtattctttta  c.561-2221

.         .         .         .         .         .           g.58940
tggcttttttcctatttagaaggcttcctttggccatttctttagggtaggtctgctagt  c.561-2161

.         .         .         .         .         .           g.59000
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.         .         .         .         .         .           g.59060
gatatttttgctggttataggattctgggttgacagttattttctttcggcattagaaac  c.561-2041

.         .         .         .         .         .           g.59120
acattgtgatgctttttttctggtgtctggtttctgatgaaaaatctcccgtcattcaaa  c.561-1981

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ttgtttttctctatgtataaggtgtcatttttctctggctgctttcaagattttttttgt  c.561-1921

.         .         .         .         .         .           g.59240
catttgttttcagaagtcatctatgatgtgccttggcaactatttgtttgcattagtccg  c.561-1861

.         .         .         .         .         .           g.59300
tatggattttgctcagcttctttaatctgtagatttaaaccacttgacaaatttgggaag  c.561-1801

.         .         .         .         .         .           g.59360
tttttagccattatttatttgaatacttttttagctccccacctctttctcttcttctgg  c.561-1741

.         .         .         .         .         .           g.59420
aattccaatgacacaaatgttacgtcttttattataatcccatgggtccctgagactctg  c.561-1681

.         .         .         .         .         .           g.59480
ttcatttctttctagtctattttcttcctgttgtgctcagtgaatgatttcttttttctt  c.561-1621

.         .         .         .         .         .           g.59540
tgttttttttttttttgagacagagtctcgctctgtcacccaggctggaatgcagtggcg  c.561-1561

.         .         .         .         .         .           g.59600
ccatcttgactcactgcaagctccgcctctcgggttcacaccattctcctgcctcagcct  c.561-1501

.         .         .         .         .         .           g.59660
cccgagtaacccggactacaggcacccaccaccacgccaagctaattttttttttttttt  c.561-1441

.         .         .         .         .         .           g.59720
tttttaagtagagatggggtttcaccatgttagccaggatggtctcgatctcctgacctc  c.561-1381

.         .         .         .         .         .           g.59780
gtgatccacccgccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcatgggccactgcgccc  c.561-1321

.         .         .         .         .         .           g.59840
ggctgtcagtgaataatttctattgcttgtctcagttcactgatccttcctctgcctcca  c.561-1261

.         .         .         .         .         .           g.59900
ttctgctgctgagcccatccactaagcttcttattttagtaatttagtttttcagttctg  c.561-1201

.         .         .         .         .         .           g.59960
atatctctgtaggactcttctttgtatcttccatttcatcactgaggctttttattattt  c.561-1141

.         .         .         .         .         .           g.60020
catttgcttcaggtgtcttcatggtggctcattaaaatatttttatcgtggctgctctaa  c.561-1081

.         .         .         .         .         .           g.60080
aattgttgtaagataatcttgatatctctgtcatctcactattggcatttgttgtttcat  c.561-1021

.         .         .         .         .         .           g.60140
tctacttgatatcttctggttcttgatataagggatatttgatggaaacctagacacttt  c.561-961

.         .         .         .         .         .           g.60200
catattgtgccgctgtagtccatgtctagtttaagccatctcttttatttggctttctct  c.561-901

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gacatgattccaacaggggaaggggctaggggactgctgcctcatactgccaggaggagg  c.561-841

.         .         .         .         .         .           g.60320
aacaattcaggggccctactcggcctccattgacatcgttgggggtttctttgttgctgc  c.561-781

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atggggagggtgcccactactcccaagtgcaggtggaagttagggctctccatgtgttct  c.561-661

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ttgctgacaccacagtgggggtggagggggtccacttgttaccaactgataggaataaaa  c.561-601

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agcctctcgagggtcaaagtctaagttcccttctcagcctttgctgacatagatggggct  c.561-481

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tgtcagtcatatcagagatgccactgatggtgaggcacaccagtattttatgtttcttag  c.561-301

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agagagattaatatatagtgagagtgtgcttcttggaatagattaaatatggtagttatg  c.561-181

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.         .         .         .         .         .           g.61040
ttatttgctatgctcatgttaacaatcagtgattggtcagcttacaaaaacaagcattcc  c.561-61

.         .         .         .         .         .           g.61100
tttttgagaatgttgacaagaccctttaaacccaatttggtggatctcttttccttgcag  c.561-1


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