Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 (SMCHD1) - 6006 nt intron 47 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.145694
gtgagtttgtttgacctgagaattatgcttggttagtttaccaaagttcttgggtctcat  c.5993+60

         .         .         .         .         .         .  g.145754
gatagctttgtttttttgagatgaagtcttgctctgttgcccaggctagagtgcagtggc  c.5993+120

         .         .         .         .         .         .  g.145814
acaatcttggctcagtgcaacctctgccttccaggcccacgggattcttgtgcctcagcc  c.5993+180

         .         .         .         .         .         .  g.145874
tcccgagtagctggcattacaggcatgcaccaccatgcttggctaattttttgtattttt  c.5993+240

         .         .         .         .         .         .  g.145934
ttgtagagatggggtttcactgtgttggccaggctaatctcaaactcctgacctcaagca  c.5993+300

         .         .         .         .         .         .  g.145994
gtctgcctgtcttggcctctcaaagtactgggattacaggtgtgagccactgcatctgac  c.5993+360

         .         .         .         .         .         .  g.146054
ttggtcatcatactttaaaaacagtatgagttcatgtctaattcttcctttgagccagaa  c.5993+420

         .         .         .         .         .         .  g.146114
ttaatattttaaattaaaaaaaataaagtaataatgaagataaaacttaagcattatgtt  c.5993+480

         .         .         .         .         .         .  g.146174
ttcttaggatactcaatcttctaaataacttgtgctaattatttagaaatgtttatattt  c.5993+540

         .         .         .         .         .         .  g.146234
tatgttaaaagtgattgttaagagtcaaattgcttgtctattttttggctcattgcattc  c.5993+600

         .         .         .         .         .         .  g.146294
tctttcagaggatcagtaacttaataagtatagaatatgcaaaaccatttgtaaatcact  c.5993+660

         .         .         .         .         .         .  g.146354
tattttaaaattgcttataatttttggtttggagaatcagatcaccaaaccattttggcc  c.5993+720

         .         .         .         .         .         .  g.146414
atttagatcaccaaaaaaccaacacagctatttccaccctaacttcatagtaagaaaact  c.5993+780

         .         .         .         .         .         .  g.146474
gtcccttttagattaaatgttagtaaagtcatcccacagaaggatatcatggtactggtg  c.5993+840

         .         .         .         .         .         .  g.146534
tttctcttttattatttcaaaaggtttaattgtagactctacctgaatatgttttctcat  c.5993+900

         .         .         .         .         .         .  g.146594
atcaaccgtagaggaattcccttgaaactatggtgtttggaattggtattctttgccata  c.5993+960

         .         .         .         .         .         .  g.146654
ttcatctgcgtattctacatttattcagtaaagatttgaaatctcactctgtgttgtatg  c.5993+1020

         .         .         .         .         .         .  g.146714
ttgctgggtgaataaaactgacatggttcttgcctccattggaattctgtaattctatgc  c.5993+1080

         .         .         .         .         .         .  g.146774
agtagagggacaatttaaaaagtaaacttttttctatttgtaaggaattacagtggctta  c.5993+1140

         .         .         .         .         .         .  g.146834
tgcctataatcccagcactttgggaggccgaggcaggtggatcacctgagatcaggagtt  c.5993+1200

         .         .         .         .         .         .  g.146894
ggagaccagcctggccaacatggcaaaaccctgtctctactaaaaataagccagtcatgg  c.5993+1260

         .         .         .         .         .         .  g.146954
tggcgcacgcctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcaggagaattgcttgaaccc  c.5993+1320

         .         .         .         .         .         .  g.147014
aagaagcggaggttgcagtgagctgagatcgcaccattgcactccagtccgggcaacaag  c.5993+1380

         .         .         .         .         .         .  g.147074
agcataactccgtctcaaaaaaaaagaaagaaaatagggaatgaaaaaatgatgaagtaa  c.5993+1440

         .         .         .         .         .         .  g.147134
tagaaaataatagggaaacaatatcagttgtctggagagatgcattgaaacagagaactg  c.5993+1500

         .         .         .         .         .         .  g.147194
aaggatgggaaggaaccagccatatagggattggtttcagtcagaggttgggaaggaggc  c.5993+1560

         .         .         .         .         .         .  g.147254
atgatgctctaagaaaataacaggtgtggcatgtttgaggaactgaaaagatgttagtgt  c.5993+1620

         .         .         .         .         .         .  g.147314
ctaaggcatggtatggtatgcaagagggagaggaccaaactattgtcggacatagaggca  c.5993+1680

         .         .         .         .         .         .  g.147374
gaggccagattatgaaactcctccctcatcatgttgcaaaaaaaatctattttaagttca  c.5993+1740

         .         .         .         .         .         .  g.147434
ttgatatctcttgagtatcacacatgtaggcatgtgaatgatgtgttcatgggcatgagg  c.5993+1800

         .         .         .         .         .         .  g.147494
tgtatacagactattaagctgatcattcaaagtgtgttggggcagtttagcatcagaaag  c.5993+1860

         .         .         .         .         .         .  g.147554
aaagactctttgcagtggatttagacatgtaacttttagaaattatgagttcaaaatgac  c.5993+1920

         .         .         .         .         .         .  g.147614
gcaaaaatcccttattggtcatcattgctggttggtagggcacctgcttgtgactgtgaa  c.5993+1980

         .         .         .         .         .         .  g.147674
aatttatgtatttatatagaaaagacatgtgtatgaactatcttccaggtttccaaatag  c.5993+2040

         .         .         .         .         .         .  g.147734
ttacagaaagttcttctttgtaaaagttattctttgtagaaagttcttatattggttaaa  c.5993+2100

         .         .         .         .         .         .  g.147794
taatatggtgtctgggatatactctaaaatactccaggaaaataaagtggcagaggatat  c.5993+2160

         .         .         .         .         .         .  g.147854
caaaataagacttggcaaaatgttttcattactaaagcttgaaataggaaattcactgta  c.5993+2220

         .         .         .         .         .         .  g.147914
ttattccctctgcttttatataggtttgccataattttttaaagaagtattttatgaaca  c.5993+2280

         .         .         .         .         .         .  g.147974
gtgggattattttttagagagaccagaacccacttcccactaaggaaattcctcaaggtg  c.5993+2340

         .         .         .         .         .         .  g.148034
cagttctaggctaagatgtaaggtacatgtttttgtgccacagtctcagcactaaatttg  c.5993+2400

         .         .         .         .         .         .  g.148094
ccctagaccttccagttactacagcgctactgtggacattgatttggaacttgttaatta  c.5993+2460

         .         .         .         .         .         .  g.148154
agattttgtagcaattcagagggagtttatgttttagtttataatattgttagtagtata  c.5993+2520

         .         .         .         .         .         .  g.148214
atgatcatcggtcatatgtgtatatatcaaatggtatagatttacagtgttgtactatac  c.5993+2580

         .         .         .         .         .         .  g.148274
gtgagtcacatatataattttaaattctctagaagccatattaaaaaggaaaaaaggaac  c.5993+2640

         .         .         .         .         .         .  g.148334
agtgagattaattttaataatagatattattgaacccaatatccaaaatatttctacatg  c.5993+2700

         .         .         .         .         .         .  g.148394
taaacaacgttaaaaatgattaatgagctattttacattctttttttttaaatacaaagt  c.5993+2760

         .         .         .         .         .         .  g.148454
cttcacaattcagaagacagcaaatctcaattaggactagctacgttgcaagtactctgg  c.5993+2820

         .         .         .         .         .         .  g.148514
agccacacacatggctggtggctaccgttttggactgcacaggtatagaaagagctgatg  c.5993+2880

         .         .         .         .         .         .  g.148574
atcgtaaaatcttgtatcctatgcatccttacccctattccatccttcagaggcaacctt  c.5993+2940

         .         .         .         .         .         .  g.148634
tgttttaactgttaatttttagttactctattgttgcctccacttttaaaagttacatta  c.5993+3000

     g.148637
tta  c.5993+3003

--------------------- middle of intron ---------------------
                                            g.148638          g.148640
                                            c.5994-3003  tga  c.5994-3001

.         .         .         .         .         .           g.148700
ctatgtaaatattgttcaggcaaatattgtactaagcaaacttgtgtgctagaattacac  c.5994-2941

.         .         .         .         .         .           g.148760
ttccttctctatatgggtctaatgtcatgactcttacttaggccaccagttagtgctcca  c.5994-2881

.         .         .         .         .         .           g.148820
aacatcaggctcaaataaatcttccttactctgttattcttaaaatcacgtgaagtgtta  c.5994-2821

.         .         .         .         .         .           g.148880
ttccaattgttactaagactctttcttgttaatttttctggagtttttaattgccacctt  c.5994-2761

.         .         .         .         .         .           g.148940
tttttttctttccctatgtatcttaatcacatcttcttcctcctgtaccagtgactagta  c.5994-2701

.         .         .         .         .         .           g.149000
actgtgcaggcctcctgtaaatctgccatcctgggtcttccttagttactctcttggatt  c.5994-2641

.         .         .         .         .         .           g.149060
atatccattatttattggattccatgtctttctctctcttataaattccttagaaaaaat  c.5994-2581

.         .         .         .         .         .           g.149120
gtgtagaaagataacttggagcccttctatgtccgaaaaatgtcttcattttgcgttcac  c.5994-2521

.         .         .         .         .         .           g.149180
gtttgattgaggttttctggagataacaggatagaaacaaggctagaatatactagaggt  c.5994-2461

.         .         .         .         .         .           g.149240
gaagggattgggaaatagtctagaaataataggagacagtctgcctgatttagccccaga  c.5994-2401

.         .         .         .         .         .           g.149300
aacactttggattcagagtcagttagaacaaaagagtgagaagtccagcaactctccctg  c.5994-2341

.         .         .         .         .         .           g.149360
tttgggagtcctgtctcccaaacagggagagtggcaaataaaaaggacggaacagaatgg  c.5994-2281

.         .         .         .         .         .           g.149420
aaaaggaaaggaagccacagcctagaatgtaccagattttcaacccaaactttgaaagct  c.5994-2221

.         .         .         .         .         .           g.149480
ttgtttccttgtcaacaggcatgaaaagatgccactacaaagttagataacaatggaaat  c.5994-2161

.         .         .         .         .         .           g.149540
gaattaaatgttggtatattggcttttggtagttgctggcacactaggacctaatgctgg  c.5994-2101

.         .         .         .         .         .           g.149600
cctctgggaactaaaaggctgataactggctctgcacctgcacatttatctattttgatt  c.5994-2041

.         .         .         .         .         .           g.149660
ttaattcaacaatttttactttatttattttgtagagatggggtcttgctgtgttgacca  c.5994-1981

.         .         .         .         .         .           g.149720
ggctggtctcaagctcctgggcttaagctactctcctgccgcggcctcccaaagtactga  c.5994-1921

.         .         .         .         .         .           g.149780
gattacaggcctgagtcaccatgctcggcccaacatccacatgtttaaagcaaaacctgt  c.5994-1861

.         .         .         .         .         .           g.149840
ggacccatgacgttgatttgccctatcccagttatagttaccatcaagtcccactcggag  c.5994-1801

.         .         .         .         .         .           g.149900
aagagacttgttggtaaaacagttctatttttataatagtagaagaaattccagctagca  c.5994-1741

.         .         .         .         .         .           g.149960
atgtaatcctctttcttaaatgtaattgtacaactaacagtcatcacacatatgagggta  c.5994-1681

.         .         .         .         .         .           g.150020
gccagcaacgtgagagacaaaattcaagattaagttccaaaatcaacatggaggacaatt  c.5994-1621

.         .         .         .         .         .           g.150080
tagtaaagagactagacctcttttataaaattataattactatgtagcagaaaggagcca  c.5994-1561

.         .         .         .         .         .           g.150140
ggacaagaatgaataaacagattacaaatattgttgctgaaataaaaatgttcaatagga  c.5994-1501

.         .         .         .         .         .           g.150200
ggattaaagtccaaaaagaaaacttccccaatacaaaaagagatagaagacatagagaac  c.5994-1441

.         .         .         .         .         .           g.150260
caattcagactattaggaatctagaaagaagaaaatggagaaggaaatgctatcatgtgg  c.5994-1381

.         .         .         .         .         .           g.150320
aagaggatttcctagggatgaataaaattcattgaatgcccagcaacagtgactgacaaa  c.5994-1321

.         .         .         .         .         .           g.150380
atactcactaagatacttcatagtaatactgtatcatatcaaggagagggagaaagagtg  c.5994-1261

.         .         .         .         .         .           g.150440
tcagtgattttagagaagccaaagaaccatattttcagtgcagcctttagtacatgggga  c.5994-1201

.         .         .         .         .         .           g.150500
gacacacacacaaagctatcatttgtttagctttgtgatggcggtattagaagtttaggt  c.5994-1141

.         .         .         .         .         .           g.150560
ggaaaatttggtgtattctggactgcgactttctcctctttgcatcctgattatattcat  c.5994-1081

.         .         .         .         .         .           g.150620
gaaatttgttaaaatcactatgagggattttctcatcctcagtcttttcctattctctat  c.5994-1021

.         .         .         .         .         .           g.150680
aaatctttaataaatctcacactctcaagaggtcagagcatttgaaataaaaatcttaac  c.5994-961

.         .         .         .         .         .           g.150740
agtattgaatattggtatatttcatccatacaatcaggaacaaatttaatagtaggaaag  c.5994-901

.         .         .         .         .         .           g.150800
gaaataggtacattatatgtgtttctgtatatttatgtttatgtttttatttacatatgt  c.5994-841

.         .         .         .         .         .           g.150860
atactgaatatatatttgttactgcttatagatcacatactatgtttcatcaactttaag  c.5994-781

.         .         .         .         .         .           g.150920
atttcattaactataaaaatgtcattttatgaaacattaaagaaaaatattgcaaattaa  c.5994-721

.         .         .         .         .         .           g.150980
ctcatgaccttataaagtacatctggatttcagagatgttaagtgtgaaaaaatatctta  c.5994-661

.         .         .         .         .         .           g.151040
gaattcattagatatgcttagcaatatatgatactatgcagtagattccattgttttctt  c.5994-601

.         .         .         .         .         .           g.151100
gaatagaggcttcagttttctaaataattttccacttataaagattaaaaattagttctg  c.5994-541

.         .         .         .         .         .           g.151160
ttaaaaatatgtatcatcttctatttggagatagttcagggaactattagaaaatattta  c.5994-481

.         .         .         .         .         .           g.151220
catatacctgaatttttaaaatctgtagctatatatgtcaaggtgctcactgtgttcatc  c.5994-421

.         .         .         .         .         .           g.151280
tctacatgaatgagattatgaatattaaatgttttattttgcttgtctttgttacttttc  c.5994-361

.         .         .         .         .         .           g.151340
tgtaataagcattataattcctgttcttaaaataataagttcatttaaggaaaagggggt  c.5994-301

.         .         .         .         .         .           g.151400
gaaaggaaaaatctgcagaatttaggtctgagataataccatttcaaagcactgtgatac  c.5994-241

.         .         .         .         .         .           g.151460
aaattacttatatatgttatatactgtgtgtgtgttaactacttttatttgggggcttgt  c.5994-181

.         .         .         .         .         .           g.151520
tttgcatacatgtgaaggaaatgattatatataaggatttaattaaatctgtttatacca  c.5994-121

.         .         .         .         .         .           g.151580
agaattatatttaaaagaatatggtttcattggatatttaagcattcaggtgtgatgagg  c.5994-61

.         .         .         .         .         .           g.151640
gaattcagggaaaggaaacctttggtacataaaacttttttttctttcccctttgaccag  c.5994-1


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