Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 (SMCHD1) - 9895 nt intron 01 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.5435
gtacgcgaaggggcgaggaagggatgcgcgtgtagacttgggggcgggagggtgatgaga  c.186+60

         .         .         .         .         .         .  g.5495
aactcaacttgctcactgagggcaataaacctgtcacccggtcccggtcctgcggccttg  c.186+120

         .         .         .         .         .         .  g.5555
gcttccctctcccgtgtgcccgccatgtccgtgacctggtggccggacgcctcgggcggg  c.186+180

         .         .         .         .         .         .  g.5615
ccctggcccgggcctcgaagtgcagggccggctcccccgtggccctccctctgcctccgc  c.186+240

         .         .         .         .         .         .  g.5675
tccttttacgggaggccttgccggcccgggtggagagctcagcgtttgttggccctgggc  c.186+300

         .         .         .         .         .         .  g.5735
gagcttagcccggttgcggccctgcagtctagggaaagccgttggtggtgtctgttttta  c.186+360

         .         .         .         .         .         .  g.5795
ctttgtaacttttttaaaacgagagaagggagttaacgcccaggggctctgttgtgagtg  c.186+420

         .         .         .         .         .         .  g.5855
ttgcgacggtgggaagttgtgaaatgcccggagtcatctcccccaagttcattagatgat  c.186+480

         .         .         .         .         .         .  g.5915
gcggggtgtccccgggttgccctgtcgaggttgcaggtccttctggggcggggcggcggg  c.186+540

         .         .         .         .         .         .  g.5975
ggggatccttccgcacggagacacttgtccaggtcagctctgcaggtagagctggccttc  c.186+600

         .         .         .         .         .         .  g.6035
tgcctgtctgagccctaacccttgggaatttccaaaccaagtcaaaggttggtatgggtg  c.186+660

         .         .         .         .         .         .  g.6095
gctgtggagcaccagaaaacgtacctaccccgtgtattggttcgctttgaaaatgaacgt  c.186+720

         .         .         .         .         .         .  g.6155
ggagggaaatccgctttaaactgtgatgtactttatagatatgaggtggtggcattgcct  c.186+780

         .         .         .         .         .         .  g.6215
gagctttgaagaaggaatattgtcatgctctgaattaaccatatgaggtccctttttaag  c.186+840

         .         .         .         .         .         .  g.6275
ctgttaagaacacttagcgtccaagggaaaaaaagaactttgaagccgtgttttgtcgtg  c.186+900

         .         .         .         .         .         .  g.6335
aggctgataggtttagaaatgttctagaccatataactgtatggttgctgaaataattga  c.186+960

         .         .         .         .         .         .  g.6395
aatcgtgatccgtagaatgaaaacgattggagaagtaaggactttcttttgttcacagct  c.186+1020

         .         .         .         .         .         .  g.6455
gtagtcccagcgtctagaactgtgcctgcgacattgtaaatgcccagattagaatggata  c.186+1080

         .         .         .         .         .         .  g.6515
aatgaatgaagacaaaaacctatcccctcaagttaattctgtgcctgaacgtagtagatt  c.186+1140

         .         .         .         .         .         .  g.6575
cccgttgtgtttgaaaagtgaatgaatgctcatcttttttgttgaatgctttctattcag  c.186+1200

         .         .         .         .         .         .  g.6635
aaccattctacaaaagggaaactttttacgtttattgtgtttatagtaaaaatatcagta  c.186+1260

         .         .         .         .         .         .  g.6695
cattaaagaaaatatggaaccagaggggggaaacaagtaaatcttttactcgctgtaaaa  c.186+1320

         .         .         .         .         .         .  g.6755
ctactatatgactactcttagcacctgaggttatgtcttttcagccttcctcctccttcc  c.186+1380

         .         .         .         .         .         .  g.6815
cactccattttttaaattactaaaatatgtgttttatattctattaattttttcacttaa  c.186+1440

         .         .         .         .         .         .  g.6875
tagtgtcagaagtttctttaaacgtaggtcttcaaatcaaaatttgaaatggtccatttg  c.186+1500

         .         .         .         .         .         .  g.6935
ctaccactatttacataaccgaatctctcctttctgttgacatttacattacttttaatt  c.186+1560

         .         .         .         .         .         .  g.6995
tttttgattttaagtaatgctgtaataaacattttcccaggcccaaatattcccgggctc  c.186+1620

         .         .         .         .         .         .  g.7055
aggtgatcctcccacctcagcctcccaagtagccaggactacaggtgagcgccaccatgc  c.186+1680

         .         .         .         .         .         .  g.7115
ccagctatgttttttttttttcgtatttttcgtacatacgggggtttggctgtgttgccc  c.186+1740

         .         .         .         .         .         .  g.7175
aggctagtctcgagctcctgggctcaagagatccacccgcctcccaaagtgctgggatta  c.186+1800

         .         .         .         .         .         .  g.7235
ctggcgtgagccactgcacccagtggaaaaacatctttgaatacatagccgtttatgtct  c.186+1860

         .         .         .         .         .         .  g.7295
tttattattgtttgcttagtttgaaatcttagaactggatcaaagatgagatacatcttt  c.186+1920

         .         .         .         .         .         .  g.7355
aaagctcttgtttcgtattttaaaattgctttttgaaaatgttttgctactttacccttc  c.186+1980

         .         .         .         .         .         .  g.7415
ctctagaaatgcactatttccctctcgtgagatgtctcagtaactcttagataaatagag  c.186+2040

         .         .         .         .         .         .  g.7475
gaagtattattggccttttattacagaagtataaacacagtcgtggaaatggtgactcat  c.186+2100

         .         .         .         .         .         .  g.7535
tactcagatagtaaagctcaagttagtattcaaacccagaacctctgttcattctgttat  c.186+2160

         .         .         .         .         .         .  g.7595
actactcaaatggcattctttgctgtagggaacagatgtatttattccttccttcaatat  c.186+2220

         .         .         .         .         .         .  g.7655
ttcaactggaaaaccaaggaaaatatttcttttaactaattctgttcctccttcctccca  c.186+2280

         .         .         .         .         .         .  g.7715
ctttatcctgctagaaaacgttttaaatttagttagaaatgagagggaccaactagtaag  c.186+2340

         .         .         .         .         .         .  g.7775
aaaaaagaaggctgagaaggctaacttttttgttgttagacttcttttaagcattattag  c.186+2400

         .         .         .         .         .         .  g.7835
attgtgcctcggatcccataactttgtctccattacgtactcgaagaactgaattaagtc  c.186+2460

         .         .         .         .         .         .  g.7895
agtgaattaataatctgagattacatggtcaacaagcagtgaaactgggattggaattta  c.186+2520

         .         .         .         .         .         .  g.7955
ggtcaatttgattccaaagcttatgtatacatatacatatatatgtgtgtgtgtatatat  c.186+2580

         .         .         .         .         .         .  g.8015
atgtatatgtatatatacatatatatacacacatacacacatatatacacatatatacgt  c.186+2640

         .         .         .         .         .         .  g.8075
gtatacgcatatatacatatatacacatatatacacatatatatacacacacatatatat  c.186+2700

         .         .         .         .         .         .  g.8135
attttttacactactccacactatttattagaaccatcacttttgtccttaggggaagag  c.186+2760

         .         .         .         .         .         .  g.8195
acaaaataatatactaaagtttttgttaaaatgtaaattaaaccaataaatgtttgtagt  c.186+2820

         .         .         .         .         .         .  g.8255
gtcaggcagtattatgggtgatcctaaactgttacttatttatttattttttttgagacg  c.186+2880

         .         .         .         .         .         .  g.8315
gagtctcgctctgttgcccgggctggagtgcagtggtgccatcttggcttactgcaacct  c.186+2940

         .         .         .         .         .         .  g.8375
ctgccacccaggttcaagtgattctcctgcctcggcctcttgagtagctgggattacagg  c.186+3000

         .         .         .         .         .         .  g.8435
tgcctgccaccacgcctggctaattttaatacttttagtagagatggggttttgccatgt  c.186+3060

         .         .         .         .         .         .  g.8495
tggccaggctgatcttgaactcctgacctcaggtggtccacctgccttggcctcccaaag  c.186+3120

         .         .         .         .         .         .  g.8555
tgctgggaatacaggcatgagccaccacgcccagctctaaattgttatttgaataaagtt  c.186+3180

         .         .         .         .         .         .  g.8615
cacctcatggaaaaggagagggaagaaatggaaaggacaaatctgcaagaagcccttaga  c.186+3240

         .         .         .         .         .         .  g.8675
cctctgataagcagctgttgactcacctgagcccttgtggccttgcagaatcaacgatta  c.186+3300

         .         .         .         .         .         .  g.8735
gaagatgactcatttggttagttctaaaatatgcccagatgttaagtcccatgtgtgcat  c.186+3360

         .         .         .         .         .         .  g.8795
atccccccaccaccaatttgaagaaattgtctacattttcctttgtgtggctccaatgtt  c.186+3420

         .         .         .         .         .         .  g.8855
ttttgttgtgcggctattctaggtgttttgtattttaatataagatgtgctcatcaattt  c.186+3480

         .         .         .         .         .         .  g.8915
ctacaataaacttgagattttgaaaaaaaaaaaaaaaaaaagcagaaaactatggcttag  c.186+3540

         .         .         .         .         .         .  g.8975
caagtgccatagtaaggtaacgaaatataatggagccacattaaaagctgactagtttgc  c.186+3600

         .         .         .         .         .         .  g.9035
agagtttcagagcagtgctaattaagctgtgtgctttctgactaatccatggatgaaaat  c.186+3660

         .         .         .         .         .         .  g.9095
tacctgttgttcagagatagtgaaaaaataattttaaaaataaaattaactgatcatttt  c.186+3720

         .         .         .         .         .         .  g.9155
ggtaggtaatcattttatgcactgcaagtcagttagtccttaaatatttaagagaagttg  c.186+3780

         .         .         .         .         .         .  g.9215
gggacggcatagtggcttacacctgtaatcccaacacttcgggaggccaaggcgggcgga  c.186+3840

         .         .         .         .         .         .  g.9275
tcacctgaggtcaggagttagagatcagcttggccaacatggtgaaaccccgtctctact  c.186+3900

         .         .         .         .         .         .  g.9335
aaaaatacaaatattagctggatctggtggcgggtgcctgtaatcccagctactcgagag  c.186+3960

         .         .         .         .         .         .  g.9395
gctgaggcagggagaattacttgaacccgggagtcggaagttgcagcgagctgagaacgc  c.186+4020

         .         .         .         .         .         .  g.9455
accgctgcactctagcctgggtggcagagcgagactcttgtctcaaaaaacaaacaaaca  c.186+4080

         .         .         .         .         .         .  g.9515
ataataaaataaaatacttagaaaaattgtgaattcaagaaataatttttatagatgaag  c.186+4140

         .         .         .         .         .         .  g.9575
cagggaaaacaaaaagatagtttatgtgtcttaattaaataataataaatttatagatta  c.186+4200

         .         .         .         .         .         .  g.9635
aaaatccatggtttttttttttttttttttgatgggagtttcactcttgtcacccaggct  c.186+4260

         .         .         .         .         .         .  g.9695
ggagtgcagtggcgcaatcttggctcactgcaacctccgcctcccaagttccagcgattc  c.186+4320

         .         .         .         .         .         .  g.9755
tcctgcttcagccttccaaatagctgggattacaggcaccagccgtcatgcccggctaat  c.186+4380

         .         .         .         .         .         .  g.9815
ttttgtatttttagtagagatgggattttaccatgttggccagggtggtctggaactcct  c.186+4440

         .         .         .         .         .         .  g.9875
gacctcaggtgatcgatctacccacctcggcctccaaaagtgctgggattacaggcatgc  c.186+4500

         .         .         .         .         .         .  g.9935
gccaccatgccccctggaaaatccatggatatttaatatggatgaaaaatccatggatat  c.186+4560

         .         .         .         .         .         .  g.9995
ttcatatggatttttgatgtggattaaaaaccatggatttttaatatggattaattttaa  c.186+4620

         .         .         .         .         .         .  g.10055
agtttattgcagcactatttacaatagtaaagacgtgggaccaacacaaatgcctattga  c.186+4680

         .         .         .         .         .         .  g.10115
tgatcaactggataaagataatgtggcacatatacaccatggaatactatgcagccataa  c.186+4740

         .         .         .         .         .         .  g.10175
aaaagaatgagatcatgtcctttgcagggacgtggatgaagctggaagccatcattctca  c.186+4800

         .         .         .         .         .         .  g.10235
gcaaactaacacaggaacagaaaaccaaacactgcatgttctcactcataagtgggagtt  c.186+4860

         .         .         .         .         .         .  g.10295
gaacaatgagaacacatgaacatagggcggggaacatcacacacagggacctgttgtagg  c.186+4920

         .         .          g.10323
gtaagaggcaaggagagggagagaatta  c.186+4948

--------------------- middle of intron ---------------------
                     g.10324            .         .           g.10350
                     c.187-4947  ggacaaatacctaatgcatgtggggct  c.187-4921

.         .         .         .         .         .           g.10410
taaatcctagatgacaggttgataggtgtggcaaaccaccatggcacatgtatatctatg  c.187-4861

.         .         .         .         .         .           g.10470
taacaaacctgcatgttctgcacatgtatccaggaacttaaaaaaaaaaaaagatagttt  c.187-4801

.         .         .         .         .         .           g.10530
gtgtgtcttaattgaataatagtagatttatagattaaaaatctatgggtttttaatatg  c.187-4741

.         .         .         .         .         .           g.10590
gattagaaatctgtgggtttttaatatggattagaaatctgtgggtttttaatatggatt  c.187-4681

.         .         .         .         .         .           g.10650
agaaatctgtgggtttttaatatggattaaaaaacatctgtgggtttttaatatggatta  c.187-4621

.         .         .         .         .         .           g.10710
aacatctgtgggtttttaatatggattaaacatctgggtttttaatatggattaaacatc  c.187-4561

.         .         .         .         .         .           g.10770
tgtgggtttttaatatgggttaaaaatcaaaagaaaatgaactatttgctccagtgcagg  c.187-4501

.         .         .         .         .         .           g.10830
aaaatacaggcaatactggatacaattagatggtcaggagcgataacccggttgccattg  c.187-4441

.         .         .         .         .         .           g.10890
tttgaagaagagaataaggtgctagcattcctatccgtagataatttgacagctaggaaa  c.187-4381

.         .         .         .         .         .           g.10950
tagggggagtcttctatgtagttagtgaaggctaaatgaactattatatgcagttatcgt  c.187-4321

.         .         .         .         .         .           g.11010
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.         .         .         .         .         .           g.11070
ctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcgggtggatcatgaggtcaggagatcgaga  c.187-4201

.         .         .         .         .         .           g.11130
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.         .         .         .         .         .           g.11370
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aataattagatatgtttaggtgaacatagatcttaaaaaaatcatttgcacatagttttt  c.187-3841

.         .         .         .         .         .           g.11490
cagtaactacaggatgcataattacatgatttaacaagtgggacattggccaggcctggt  c.187-3781

.         .         .         .         .         .           g.11550
ggctcacgcctctaatcccagcactttgggaggccaaggcagggagatcatctgaggtca  c.187-3721

.         .         .         .         .         .           g.11610
ggagtttgagaccagctggccaacgtggtgaaactctgtctctactaaaaatgcaaaaat  c.187-3661

.         .         .         .         .         .           g.11670
tagccaggtgtggtggcacacgcctgtagtcccagctgcttgggaggcagaggcaggaga  c.187-3601

.         .         .         .         .         .           g.11730
atggtgtgaacccgggcggcggagcttgcagtgagctgagatcgtgccattgcactccag  c.187-3541

.         .         .         .         .         .           g.11790
cctgcacaacagagcaagactccatctcaacaacaataacaacaaaaaaccaaaaaaaaa  c.187-3481

.         .         .         .         .         .           g.11850
aaaaaaaaaaaaaagggacatcatagaaataaaaaagtagtaatgaattaaaaaatacac  c.187-3421

.         .         .         .         .         .           g.11910
gactgtcatggttatatgaaacctaataaaaatctataaggtcatttttgtctctgttaa  c.187-3361

.         .         .         .         .         .           g.11970
acaaatagaatcttcccagtcagtttatgttcatggctttatttctctagggtggaattg  c.187-3301

.         .         .         .         .         .           g.12030
catggaatatgagtatcttttaagtttactaaagtatgccaaattaattactttctttat  c.187-3241

.         .         .         .         .         .           g.12090
gtttgactttttttcagtcatatcagcagtgtgtaaggtacctatttctctgtacagagg  c.187-3181

.         .         .         .         .         .           g.12150
cctacacttgatgggctcagaatttaacatttttgcctacctgatgagaataagttatat  c.187-3121

.         .         .         .         .         .           g.12210
taatttcactgataactagtgatgttgatctttttatgttgtctggtctttttctttatg  c.187-3061

.         .         .         .         .         .           g.12270
acttgtgctatttgcatcttttgagacagagtctcactcaaaagtcacccaagctagagt  c.187-3001

.         .         .         .         .         .           g.12330
gcagtagtgtgtgatcacggctcactgcagcctcggcttcccaggctcaggggatcgtcc  c.187-2941

.         .         .         .         .         .           g.12390
aacctcagcctcttgagtggttgtgactacacgtgtgcaccaccatgcccagctattttt  c.187-2881

.         .         .         .         .         .           g.12450
tttttttccattttttgtagagatggggttttaccacattgcccaggctggtcttgaact  c.187-2821

.         .         .         .         .         .           g.12510
cctgagttcaagcaatccgcccaccttggcctcccagagtgctgggattacagctgtgaa  c.187-2761

.         .         .         .         .         .           g.12570
ccactgtgcctggcccactgtttgtaccttttcagaaatccctttatgctcactcaaaat  c.187-2701

.         .         .         .         .         .           g.12630
tatttccctatgtgttcttttacaattttgggctaatgtacaactgctttaattctcctg  c.187-2641

.         .         .         .         .         .           g.12690
gaatttatttttgtctaagttaaggtgtggattttatctgtttccatgttgagataacta  c.187-2581

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gttgtcttaatatcattcattggatagtttattctttccccaccaatttgtaatgtcacc  c.187-2521

.         .         .         .         .         .           g.12810
tctcttgtttgctaggctctgcatccatatatatgtggacctgtctaagggccctctatt  c.187-2461

.         .         .         .         .         .           g.12870
ctcttccactggtctattccaggaatttttttttttaagacggagtctcgctctgtcgcc  c.187-2401

.         .         .         .         .         .           g.12930
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gctaatttttttgtacttttagtagagacggggtttcaccgtgttagccaggatggtctc  c.187-2221

.         .         .         .         .         .           g.13110
gatctcctgccctcgtgatccaccctcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggttt  c.187-2161

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gagccaccgcgcccggcctattccaggatattttaaagtagaaattttcttatgaaaacc  c.187-2101

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ttcagacacaaagagagaatcatgttatgaaccccagtgtactcatccagattcaagtta  c.187-2041

.         .         .         .         .         .           g.13290
ataggaatttaccacactaggatcatttttgtttttgtaatgtatttaaggcatattcta  c.187-1981

.         .         .         .         .         .           g.13350
ggtcttaggtcatttcaccccatatacttcagcctgaatatgtattatcaaaccattaaa  c.187-1921

.         .         .         .         .         .           g.13410
ataaagcatttttaatattgtctaatgtccctgtccatattgagttctctgaatgtttaa  c.187-1861

.         .         .         .         .         .           g.13470
aagtatctttttatagttggtttgtttaaatcaggatctgacatagtcctcacattaaat  c.187-1801

.         .         .         .         .         .           g.13530
ttgttttttttttgtttcctaattattttcaatttaaagcatttgagcaaattcctcctc  c.187-1741

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caccagtctctttagttttcctgcagttgacctcttgaagaaatcaactaggtctttaat  c.187-1681

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tcttgggattcacgtgatttcagcaggattcctccataaggaagttttgatctgacttgc  c.187-1381

.         .         .         .         .         .           g.13950
cattcctcctgtgtttattagctggaattctttaaggaacaactttgcctcatcagccag  c.187-1321

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.         .         .         .         .         .           g.14070
ctttccctttaatttgtcagtgttcagagtgacaagttggtgccctagctcatcccagtg  c.187-1201

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ttttttagatgttttcaataagaatgttaatctttagactagtccattactacccgaaac  c.187-1081

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agaagccttttctcttaactatatattgctgtattgtttcattttagacagagcatgtat  c.187-1021

.         .         .         .         .         .           g.14310
gttttaattctaatgtaaatgaaaatgttaaccacttttctaattctcattttttgatta  c.187-961

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atgtgattttacagttcatgtgttcattggtcatttgtattttctccttttcattttttt  c.187-901

.         .         .         .         .         .           g.14430
gtgtttttactttttctctttgttgatccttgtcacccttttgtttcttgttgcaatttc  c.187-841

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.         .         .         .         .         .           g.14550
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.         .         .         .         .         .           g.14610
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.         .         .         .         .         .           g.14670
ttttagtagagacagggtttcaccatgttggtcgggctggtcttgaactcctgaccttgt  c.187-601

.         .         .         .         .         .           g.14730
gatccgacggcctcagcctcccaaagtgctgggatgacaggcatgagctaccatgcctgg  c.187-541

.         .         .         .         .         .           g.14790
ccagtttccctctaatttataatttgctttaatttttaaagttattcgtttgaatggacc  c.187-481

.         .         .         .         .         .           g.14850
tgtatgtcttacaaagcatggctgttcttccctccgtgctataaaatgctaacttctgtt  c.187-421

.         .         .         .         .         .           g.14910
ttcttctattttgtttttgcatacttaaatatctagtctatatgaacatgagttatgtta  c.187-361

.         .         .         .         .         .           g.14970
aagctttgttccaaataagttgataacttgtacgttagtatgaaatactatgtcttttgt  c.187-301

.         .         .         .         .         .           g.15030
ctgggtgggtcctgctgatgatgttaaaatgcttttaaaacgttccacctaatcactagt  c.187-241

.         .         .         .         .         .           g.15090
gttcctaggttgcttatagtagcagaaaaaatgaccttgttaagtaagtaatttatatag  c.187-181

.         .         .         .         .         .           g.15150
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.         .         .         .         .         .           g.15210
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.         .         .         .         .         .           g.15270
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