numbering in relation to cDNA Reference Sequence
(last modified December 15, 2006)
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tatatatataccacttttttatccatttatctgttaatggcacttagaaaacaatttcat -131941
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ttacagtatcatcaggaagaataaaagaggaataaatttaactaaaatggtgaaatattt -131881
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ggagtctggctctgtcgcccaggctggagtgcaatgacgggatctctgctcactgcaacc -131761
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tcttttaacaaatactgattcacgattagtatttttaaaatacaaaatgcattttcctga -128821
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atagcatttatttacttgttaaagaagttgtgtaagagattcagctaatctaatttctta -128761
. . . . . .
ctttgtgaagaaatcactcatctaaagtcaaaatatcaagtataaagtctacccttggga -128701
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gaagcatacagggtgccagactttaaatatctccagtgtgcaaaataaataatattttct -128641
. . . . . .
tgaaatatcctcttatttgaaaatttgctatagagtcacaagaggcaaattccatttgag -128581
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aaagtgcatgctatattttacaacgcagaaatgtggagctgagcacacaacatcttattg -128521
. . . . . .
caaaagtacaattcagaagagagtttttacccttaaaaggctgtgaagataagtaaaaat -128461
. . . . . .
cagccaaaatttcagtgtgaataatatgatgtttggcgaggaactctactattgttacac -128401
. . . . . .
ttaggaaaataatctaatccaaaggctttgcatctgtacagaagagcgagtagatactga -128341
start Dp427c exon 1
. . . . . | .
aagagatttgcagatccactgttttttaggcaggaagaatgct | cgttaaatgcaaacgct -128281
. . . . . .
gctctggctcatgtgtttgctccgaggtataggttttgttcgactgacgtatcagatagt -128221
. . . . . .
cagagtggttaccacaccgacgttgtagcagctgcataataaatgactgaaagaatcatg -128161
. . . . . .
ttaggcatgcccacctaacctaacttgaatcatgcgaaaggggagctgttggaattcaaa -128101
. . . . . .
tagactttctggttcccagcagtcggcagtaatagaatgctttcaggaagatgacagaat -128041
. . . . . .
caggagaaagatgctgttttgcactatcttgatttgttacagcagccaacttattggcat -127981
Dp427c intron 1
. . . . | . .
gatggagtgacaggaaaaacagctggcATGGAAG | gtaggattattaaagctattacatca -127921
M E D
amino acid numbering p.Met12-3 to p.Asp12-1
(alternatively Dp427c:p.Met1 to Dp427c:p.Asp3)
. . . . . .
ttacaaatacaattagaagctggccatgacaaagcatatgtttgaacaagcagctgttgg -127861
. . . . . .
tagctggggtttgttgccgagctcttcaaactctgcaaacagtgttgcttttacagaatg -127801
. . . . . .
gattttaaaattgccttgtgctgcgttagattttggggagggggtgtgcttgcctccaac -127741
. . . . . .
ctcaggaaaacacttctgggatagaaatcagtgttagaagattttagaataaagtattgt -127681
. . . . . .
tcaggagtctaggtttcttcaggtagatgatgacagggggaaaaaaatcttcggggaaat -127621
. . . . . .
ctaccccagattagttatatgcaatttagttgcaagaactgattgatgtattggcatatt -127561
. . . . . .
cagacagtgagagaaatgagaatgtacagaatgtttggataggttgaaaattgttatact -127501
. . . . . .
tggtttctattttataaggagtttggctgtcagtcatttctcctcatcaatttctagctt -127441
. . . . . .
ttgacatttattcagtcattctgcattatatgaagaaaatatatcaatatctcctgcagg -127381
. . . . . .
gtttttcaacaactctagcatctgtttcagctattgaactgtattcacgttttgccaagt -127321
. . . . . .
tgatgtcgacccagctggtctatgatttctcgcttgattactgctcttaatttctctgta -127261
. . . . . .
tcagcttgtttcagatagggctttgaaggctgttaatgaaaaatgacagaagtgataaat -127201
. . . . . .
tattgaaaatgtgagcatttatttatttatttatttatttatttatttattttgcccttt -127141
. . . . . .
aatgagttttgtcttacattctttcttgcctgcgtacgatttttagaaccctttctctgt -127081
. . . . . .
tttgcaatatttctttcccctacaatcagtggattataattataagtacttttaagcaaa -127021
. . . . . .
tggagcatgagcatggacagtatttggctccaaaaataaagtttttggagaaaggggagc -126961
. . . . . .
aatttatgctttttgtataaactatgcatcgtttctataacctatcttcacatgctgtca -126901
. . . . . .
tggggatctgtcagtgactgtaatcagactgaacatattgaaataatctttatcaccact -126841
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agggtaacaagcaaataaaacattcaaacatttaacaagtgattgtttaaaacagatgtt -126781
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aaataatatagaaatagattttcctaagtgtgaaaagcctgattattaactgtctatgta -126721
. . . . . .
atacagaatctttcggctctctacccagtctcctccatagcctgaggagctaaatcatcc -126661
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aagttaatagactatcatatatgtacatctaatatgacctttcagtgtacacagtgctac -126601
. . . . . .
tcgtatgtgctgtgccttttctgtagtaattgtaatatcccagtcagtctggttaaggaa -126541
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cactattggctgttatgtaactttttttctgaatgttagtccatggttttcaattacgta -126481
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tattctaaaacaattatttatctcttttaggtaaaaattttattgagcatcattattttt -125221
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taagtaaaaaaatctcccttatttctctttttgtgataagactgtcaagtgaaatttccc -125161
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cactatcggttaagaaatatgctttgaaatgttttgcctgagaagcttgctccatcctat -125041
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tatcctcccattctcatataatccatcttttaagaaggaaaaagcaaataaaaacaaacc -124981
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aatcagaacacagttgagcattgtttgaattcacagagcttgccatgctggaagcacaac -361
. . . . . .
cttatatgtagtgaccatggacagtcctattatgggaaaccaacttgagagagaaggcgg -301
. . . . . . | 1
gtcacttgcttgtgcgcaggtcctggaatttgaaatatccgggggcctctacagaa | tcct -241
. . . . . .
ggcatcagttactgtgttgactcactcagtgttgggatcactcactttccccctacagga -181
Legend:
Nucleotide numbering is indicated at the right of the sequence, counting the A of the ATG
translation initiating Methionine as 1. Every 10th nucleotide is indicated by a "." above the
sequence. The Dystrophin protein sequence is shown below the cDNA sequence, with numbering
indicated at the right starting with 1 for the translation initiating Methionine. Every 10th
amino acid is shown in bold. The position of introns is indicated by a vertical line, splitting
the two exons. The exon number is indicated above the first nucleotide(s) of the exon. To aid
the description of frame shift mutations, all stop codons in the +1 frame are shown in bold
while all stop codons in the +2 frame are underlined.
Ivo Fokkema / Johan den Dunnen